土豆的施肥主要以有机肥为主要使用肥料，可以适当地使用一些化肥，重施基肥，早施追肥，这就是土豆的用肥原则，因为有机肥里面富含有机物可以疏松土壤，提高土壤的肥力，可以配合使用一些微生物菌剂来使用，微生物可以让有机肥充分腐熟，以此来提高土壤的肥力。
微生物菌剂中有益微生物能产生糖类物质，与植物粘液、矿物胚体和有机胶体结合在一起，可以改善土壤团粒结构，有效打破土壤板结。微生物菌剂还可以促进团粒结构的形成，并能改善土壤的通气状况，促进有机质、腐殖酸和腐殖质的生成。
微生物菌剂的微生物，例如抗生性微生物，它们能够分泌抗生素，抑制病原微生物的繁殖，这样就可以防治和减少土壤中土传病害微生物对作物的危害，提高土豆产量和品质。微生物菌剂还可以对土壤进行“解毒”和“保健”，调控和维护土壤的健康质量。
微生物菌剂还具有解磷、解钾、固氮的作用，促进土壤中微量元素的释放及螯合，可提高肥料利用率10％～30％。在一定的条件下，还能参与腐殖质形成，有利于提高土壤肥力。
